体细胞无性系变异遗传稳定、后代稳定，试验重复性好，诱变条件可控，不受季节限制，效率高，选育周期短，成本低。

体细胞无性系变异的遗传基础： （1）染色体组型变异，如出现多倍体和非整倍体。 （2）染色体结构变异，由染色体重排造成的基因丢失，或“关闭”一个能使其相应隐性基因产生表现型效应的显性等位基因等。 （3）基因突变。 （4）DNA总量变异和DNA重复序列拷贝数的变异。 （5）基因丢失。 （6）DNA碱基修饰。 （7）转座子的激活，由转座引起突变。 （8）基因重排。